В институте функционируют 5 научно-исследовательских лабораторий, научно-производственный центр «Технолог» и центральная научная библиотека:
1. Лаборатория «Топливные ресурсы и переработки угля», заведующий лабораторией н.с. Сабиров Б. З.;
2. Лаборатория «Газификация угля», заведующий лабораторией к.т.н. Шайдуллаев Р. Б.;
3. Лаборатория «Нетопливное использование угольных ресурсов» заведующий лабораторией к.х.н., Джапарова Ш.;
4. Лаборатория «Перспективные технологии и материалы», заведующий лабораторией д.ф-м.н Ташполотов Ы.;
5. Лаборатория «Природный камень и техногенное сырье» заведующий лабораторией к.т.н., доцент Калдыбаев Н.А.;
6. Лаборатория «Нетрадиционные источники энергии» заведующая лабораторией, д.т.н. Абдуллаева М.Д.;
7. Научно-производственный центр «Технолог», зав. центром «Технолог» Токтоназаров С. Т.;
8. Центральная научная библиотека.
9. Персональ административная-управления.
10. Персональ технический обслуживания.